| 順位 | 本 | チーム |
| 1 | 10 | ツエーゲン金沢 |
| 高知ユナイテッドＳＣ | ||
| 3 | 11 | 栃木シティ |
| 4 | 15 | 藤枝ＭＹＦＣ |
| ＦＣ岐阜 | ||
| 6 | 20 | ＳＣ相模原 |
| 7 | 23 | テゲバジャーロ宮崎 |
| 8 | 24 | ＦＣ大阪 |
| ロアッソ熊本 | ||
| 10 | 25 | いわきＦＣ |
| 11 | 26 | ファジアーノ岡山 |
| 12 | 27 | 鹿児島ユナイテッドＦＣ |
| 13 | 28 | ヴァンラーレ八戸 |
| 14 | 31 | ガイナーレ鳥取 |
| 15 | 32 | 奈良クラブ |
| 愛媛ＦＣ | ||
| 17 | 33 | カマタマーレ讃岐 |
| 18 | 35 | 栃木ＳＣ |
| 19 | 38 | 福島ユナイテッドＦＣ |
| 20 | 39 | ＦＣ今治 |
| ギラヴァンツ北九州 | ||
| 22 | 40 | ザスパ群馬 |
| ＦＣ琉球 | ||
| 24 | 64 | ブラウブリッツ秋田 |
| ＡＣ長野パルセイロ | ||
| 26 | 68 | レノファ山口ＦＣ |
| 27 | 70 | ＦＣ町田ゼルビア |
| 28 | 76 | カターレ富山 |
| 29 | 118 | 水戸ホーリーホック |
| 30 | 209 | 松本山雅ＦＣ |
| 31 | 223 | 徳島ヴォルティス |
| 32 | 276 | Ｖ・ファーレン長崎 |
| 33 | 369 | モンテディオ山形 |
| 34 | 403 | 横浜ＦＣ |
| 35 | 746 | ヴァンフォーレ甲府 |
| 36 | 923 | 大分トリニータ |
| 37 | 936 | アビスパ福岡 |
| 38 | 960 | サガン鳥栖 |
| 39 | 989 | ＲＢ大宮アルディージャ |
| 40 | 1056 | 京都サンガF.C. |
| 41 | 1158 | 東京ヴェルディ |
| 42 | 1201 | ベガルタ仙台 |
| 43 | 1248 | 北海道コンサドーレ札幌 |
| 44 | 1277 | 湘南ベルマーレ |
| 45 | 1300 | アルビレックス新潟 |
| 46 | 1350 | 川崎フロンターレ |
| 47 | 1508 | ジェフユナイテッド千葉 |
| 48 | 1671 | セレッソ大阪 |
| 49 | 1697 | ヴィッセル神戸 |
| 50 | 1754 | ジュビロ磐田 |
| 51 | 1817 | ＦＣ東京 |
| 52 | 1904 | 柏レイソル |
| 53 | 1958 | サンフレッチェ広島 |
| 54 | 2107 | 浦和レッズ |
| 55 | 2274 | 鹿島アントラーズ |
| 56 | 2291 | ガンバ大阪 |
| 57 | 2316 | 名古屋グランパス |
| 58 | 2347 | 横浜Ｆ・マリノス |
| 59 | 2373 | 清水エスパルス |